Apesar de pertencer à mesma geração, o iPhone 16e apresenta algumas limitações importantes em relação ao irmão mais caro. O conjunto fotográfico, por exemplo, conta com apenas um sensor traseiro de 48 MP, enquanto o iPhone 16 adiciona uma câmera ultrawide de 12 MP. A autonomia também favorece o modelo convencional: segundo testes do GSM Arena, o 16e registrou 11h53 de duração, contra 15h42 do iPhone 16, uma vantagem de 3h49 para o segundo. Já em relação à tela, o modelo mais acessível alcança 1.200 lêndeas de brilho, enquanto o painel do iPhone 16 chega a 2.000 nits.